С помощью самого быстрого в мире суперкомпьютера и передовых технологий учёные совершили прорыв в области высокопроизводительных вычислений (HPC) и квантовой химии. Это открытие может произвести революцию в создании лекарств и поиске новых методов лечения ряда заболеваний. Под руководством Джузеппе Барка, доцента Мельбурнского университета и эксперта в области HPC, исследовательская группа впервые провела моделирование биологических систем на уровне, необходимом для точного изучения эффективности лекарств. С помощью суперкомпьютера Frontier команда разработала новое программное обеспечение для точного прогнозирования химических реакций и физических свойств молекулярных систем, состоящих из сотен тысяч атомов. Это устанавливает новый стандарт в вычислительной химии. В проекте участвовали Национальная лаборатория Оук-Ридж, компания AMD и стартап QDX. Это достижение — результат более чем четырёхлетних исследований — позволяет изучать биомолекулярные системы с точностью до квантового уровня. Передовое моделирование даёт возможность наблюдать и понимать эти системы в беспрецедентных деталях, что поможет лучше оценивать традиционные лекарства и разрабатывать новые терапевтические средства. Благодаря этому открытию мы можем моделировать поведение лекарств так же точно, как в физических экспериментах. Мы видим, как меняется лекарство со временем: как разрываются и образуются связи в биологической системе. Это поможет оценить эффективность лекарств и разработать новые методы лечения, — говорит доцент Барка. Более 80% белков, вызывающих заболевания, не поддаются лечению существующими препаратами. Только два процента работают с известными лекарствами. Передовая квантовая механика и высокопроизводительные вычисления помогают быстрее и точнее открывать новые лекарства. Они также позволяют понять то, что было недоступно традиционной вычислительной химии. Это помогает найти новые способы лечения заболеваний. В ходе моделирования вычисляется, насколько молекула лекарства близка к определённой цели — например, мутировавшему белку, вызывающему заболевание. Алгоритмы оценивают прочность связи между лекарством и мишенью, что говорит об эффективности препарата. Чтобы протестировать лекарство с помощью квантового моделирования, биологическая модель системы должна включать тысячи атомов.
Представитель AMD в Национальной лаборатории Оук-Ридж, доктор Якуб Курзак, рад, что технологии высокопроизводительных вычислений AMD помогут совершить прорыв в медицине. Они обеспечат необходимую производительность для точного моделирования сложной физики молекулярных систем при поиске лекарств. Генеральный директор QDX Лун Ванг: «Мы рады преобразовать научные достижения в удобную платформу для поиска лекарств. Наше квантовое моделирование обеспечивает высокую точность. Мы надеемся, что это поможет быстрее и дешевле разрабатывать новые лекарства от сложных болезней».
31.07.2024 |
Здоровье
PNAS: Выяснилось, что мешает восстановлению ДНК при болезни Хантингтона | |
У пациентов с болезнью Хантингтона изменё... |
Science Advances: Эстрогены — серые кардиналы рака — подавляют эозинофилы | |
Эстрогены способствуют росту опухолей в к... |
Cyborg and Bionic Systems: Датчики и ИИ персонализируют лечение боли | |
Обзорную статью, в которой собрали послед... |
iScience: Определен механизм в основе образования мембран во время гаметогенеза | |
Половое размножение — это расп... |
The Journal of Immunology: Открыта роль макрофагов при остром повреждении почек | |
Острая почечная недостаточность, ОПН, &md... |
PNAS: Исследование ДНК в нервных клетках покажет, как они восстанавливаются | |
Учёные из Медицинского центра Векснера Ун... |
Шарики, увеличивающиеся в воде, следует держать подальше от маленьких детей | |
Учёные провели исследование и выяснили, ч... |
Science: Ученые разрабатывают новый препарат для борьбы с малярией | |
В 2022 году почти 619 000 человек в мире ... |
PLoS Biology: Создана модель ИИ для определения оптимальных пар белков в клетках | |
Транспортные белки отвечают за перемещени... |
JCEM: Задержкой развития у младенца грозят регулярные недосыпы беременных женщин | |
Недосып у беременных может привести к&nbs... |
NPJ Parkinson’s Disease: Исследование дает надежду на лечение болезни Паркинсона | |
Болезнь Паркинсона, второе по распростран... |
NatComm: Люди с некоторыми психическими диагнозами реже прививаются от COVID-19 | |
Учёные из Каролинского института провели ... |
AJCN: 80% женщин испытывают дефицит железа к третьему триместру беременности | |
Во время беременности потребность женщины в&nb... |
NatComm: Исследователи нашли антитела против бактерии Klebsiella pneumoniae | |
Исследователи из Утрехтского университета... |
Science Translational Medicine: Открыт новый метод лечения фиброза печени | |
Исследование фармацевтического факультета Питт... |
Ученые намерены разработать цифровые инструменты для борьбы с депрессией | |
Физическая активность связана с депрессие |
PNAS Nexus: Свиньи могут быть звеном передачи крысиного гепатита Е людям | |
Исследования показали, что свиньи могут п... |
AJRCMB: У курильщиков и вейперов обнаружены схожие изменения в ДНК | |
Учёные из Медицинской школы Кека при ... |
Cancer Discovery: Клетки рака разметили, чтобы понять, как развиваются метастазы | |
Метастатический рак — это очен... |
Nature Medicine: ИИ прогнозирует, как генетические варианты влияют на здоровье | |
Предрасположенность к заболеваниям во&nbs... |
Advanced Materials: Новый спрей защитит от множества респираторных инфекций | |
Исследователи из Бригама разработали наза... |
FMicB: Антитело для Campylobacter jejuni дает надежду на разработку вакцины | |
Бактериальные инфекции, вызывающие энтерит и&n... |
EHP: Шум аэропорта нарушает качество, а не длительность сна, но все еще впереди | |
Шум от самолётов по ночам нарушает с... |
В России разработан новый алгоритм лечения пациентов с повреждениями костей таза | |
В конце декабря 2023 года группа учёных кафедр... |
Nature Neuroscience: Нейростимуляция контура мозга поможет в лечении ПТСР | |
Учёные из больницы Brigham and Women's Ho... |
Nature Communications: Раскрыт механизм, запускающий аутофагию | |
Новый механизм аутофагии — процесса... |
Проблемы со зрением и сфинктером могут предсказать развитие рассеянного склероза | |
Учёные из Федерального университета Баии ... |
Frontiers in Toxicology: В пищевой упаковке найдены сотни канцерогенов | |
Исследователи определили около 200 потенциальн... |
PsychRes: У тучных во время беременности матерей чаще рождаются аутисты | |
У детей, чьи матери страдали ожирением до... |
JPC: Открыты ключевые моменты в структуре холестерина в клеточных мембранах | |
Влияние холестерина на клеточные мембраны... |