Microbiome: Разработана возможная альтернатива традиционной метагеномике

Микробиом человека влияет на всё: от развития заболеваний до реакции на лечение. Поэтому учёные всего мира изучают его.

Традиционная метагеномика даёт ценные сведения, но не позволяет определить микробное разнообразие на уровне штаммов и точно выявить гены, которые отвечают за устойчивость к антибиотикам. Это подчёркивает необходимость применения более совершенных подходов.

Исследователи из Университета Васэда под руководством доцента Масахито Хосокавы совместно с компанией bitBiome, Inc. разработали новый метод изучения генома одной клетки. Этот метод может стать альтернативой традиционной метагеномике.

Исследование опубликовано в журнале Microbiome. Оно посвящено изучению микробного разнообразия и генетических особенностей с помощью одноклеточного геномного анализа.

Хосокава отмечает, что ограничения метагеномики вдохновили их на разработку нового подхода к изучению микробиома человека на уровне одной клетки. Это позволит лучше понять взаимодействие бактерий и обмен генетическим материалом, включая гены устойчивости к антибиотикам.

Исследователи провели масштабный анализ микробов в организме человека. Они собрали образцы слюны и кала у 51 участника. Затем они применили новый метод анализа генома одной клетки, который называется SAG-гелевая технология (продается под названием bit-MAP® компанией bitBiome, Inc.). В этом методе отдельные бактерии помещаются в гель, их геномы амплифицируются и анализируются по отдельности.

С помощью этой методики исследователи обнаружили геномы 300 видов бактерий, которые были пропущены обычным методом. Также новая методика позволила глубже понять гены устойчивости к антибиотикам, сети обмена генами, взаимодействие бактерий и их разнообразие.

Результаты этого исследования полезны в разных областях.

В здравоохранении детальное профилирование генов устойчивости к антибиотикам поможет разработать более эффективные стратегии лечения, предотвратить заболевания и сократить расходы на здравоохранение.

При мониторинге окружающей среды одноклеточная геномика позволяет отслеживать генетические сдвиги в экосистемах и предотвращать распространение устойчивости к антибиотикам.

Понимание динамики генов устойчивости в сельском хозяйстве поможет минимизировать их распространение через почву, воду и домашний скот.

Исследование показало, как изучение генома одной клетки помогает понять работу микробных сообществ.

Хосокава считает, что это позволит лучше бороться с устойчивостью бактерий к антибиотикам и принесёт пользу медицине.

07.10.2024


Подписаться в Telegram



Здоровье

В МФТИ создают новую систему медицинской реабилитации
В МФТИ создают новую систему медицинской реабилитации

По статистике ВОЗ, около 2,4 миллиарда человек...

В ННГУ разрабатывают калькулятор биологического возраста
В ННГУ разрабатывают калькулятор биологического возраста

Калькулятор биологического возраста для ж...

PLOS ONE: У правшей и левшей различается химический состав ключичных костей
PLOS ONE: У правшей и левшей различается химический состав ключичных костей

Учёные исследовали скелетные останки человека ...

Сеченовский университет: обнаружено ещё одно последствие COVID-19
Сеченовский университет: обнаружено ещё одно последствие COVID-19

У детей, которые ранее перенесли коронав...

Menopause: Ученые заподозрили роль эстрогена в развитии астмы
Menopause: Ученые заподозрили роль эстрогена в развитии астмы

Слишком ранний возраст наступления менопаузы п...

Nature Communications: Жизнь все-таки можно повернуть назад
Nature Communications: Жизнь все-таки можно повернуть назад

Клетка похожа на шумный мегаполис, в ...

EBioMedicine: Создан инструмент для выявления сепсиса у новорожденных
EBioMedicine: Создан инструмент для выявления сепсиса у новорожденных

Генетическая сигнатура новорождённых может пре...

В Университете Льва Толстого разработали импортозамещающие лекарства
В Университете Льва Толстого разработали импортозамещающие лекарства

Ученые Центра технологического превосходства Т...

PNAS: Появилось новое понимание того, как мутации влияют на болезни
PNAS: Появилось новое понимание того, как мутации влияют на болезни

Многие статистические модели и алгоритмы&...

В ЛЭТИ представили алгоритм ранней диагностики патологий беременности
В ЛЭТИ представили алгоритм ранней диагностики патологий беременности

Разработка позволит прогнозировать протекание ...

Поиск на сайте

Знатоки клуба инноваций


ТОП - Новости мира, инновации

Открыта связь депрессии с нарушением формирования функциональной сети мозга
Открыта связь депрессии с нарушением формирования функциональной сети мозга
Nature Chemistry: Протоклетки помогут биохимикам понять, как зародилась жизнь
Nature Chemistry: Протоклетки помогут биохимикам понять, как зародилась жизнь
В Воронеже разработали новый метод извлечения коллагена из кожи пресноводных рыб
В Воронеже разработали новый метод извлечения коллагена из кожи пресноводных рыб
В ТПУ создали многоразовые накопители водорода из отечественного сырья
В ТПУ создали многоразовые накопители водорода из отечественного сырья
Новый подход к производству цифрового света решает проблемы 3D-печати
Новый подход к производству цифрового света решает проблемы 3D-печати
В МФТИ создают новую систему медицинской реабилитации
В МФТИ создают новую систему медицинской реабилитации
Простой анализ крови поможет предотвратить преэклампсию у рожениц
Простой анализ крови поможет предотвратить преэклампсию у рожениц
Показал высокую эффективность: ученые СПбГУ создали гидрогель для лечения ран
Показал высокую эффективность: ученые СПбГУ создали гидрогель для лечения ран
Cancer: Аэробные упражнения рассеивают туман в мозге, вызванный химиотерапией
Cancer: Аэробные упражнения рассеивают туман в мозге, вызванный химиотерапией
The Lancet Planetary Health: Жара влияет на физическое развитие младенцев
The Lancet Planetary Health: Жара влияет на физическое развитие младенцев
В ННГУ разрабатывают калькулятор биологического возраста
В ННГУ разрабатывают калькулятор биологического возраста
NC: Ученые ищут способ понять, как клетки чувствуют и реагируют на воздействие
NC: Ученые ищут способ понять, как клетки чувствуют и реагируют на воздействие
Nature Genetics: Повторный генетический анализ улучшит диагностику миллионов
Nature Genetics: Повторный генетический анализ улучшит диагностику миллионов
Microbiome: Разработана возможная альтернатива традиционной метагеномике
Microbiome: Разработана возможная альтернатива традиционной метагеномике
Искусственный «нос» может учуять испорченные фрукты и испорченное мясо
Искусственный «нос» может учуять испорченные фрукты и испорченное мясо

Новости компаний, релизы

Международные эксперты оценили разработанную для нижегородского завода технологию
На старт! Внимание! MITEX!
Фестиваль научных театров «Наука всем!» прошёл в Санкт-Петербурге
Всероссийский исторический кроссворд собрал 15 тысяч участников
«Вертолеты России» представили на саммите БРИКС Ми-171А3 AURUS, Ми-38 и модернизированный Ансат