Nature Genetics: Повторный генетический анализ улучшит диагностику миллионов

Учёные провели масштабное исследование влияния рецессивных генетических изменений на развитие нарушений. Они выяснили, что большинство недиагностированных случаев связаны с известными генами. Исследователи предложили изменить направление работы для улучшения диагностики.

Специалисты из Института Веллкома Сангера и компании GeneDx изучили генетические данные почти 30 000 семей с нарушениями развития. Это в шесть раз больше семей, чем в предыдущих исследованиях.

Исследователи обнаружили несколько новых генов, связанных с определёнными состояниями.

Оказалось, что известные гены объясняют более 80 процентов случаев, вызванных рецессивными генетическими вариантами. Это больше, чем предполагалось ранее.

В разных этнических группах рецессивные гены вносят разный вклад в нарушения развития.

Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Genetics. Они помогают лучше понять генетическую основу нарушений развития и подчёркивают важность учёта генетического фона человека при диагностике и проведении исследований.

Команда считает, что в последние годы успешно искали рецессивные гены, связанные с нарушениями развития. Теперь задача — правильно интерпретировать генетические изменения в этих генах.

Такой подход может помочь диагностировать в два раза больше пациентов, чем поиск только новых генов.

Многие нарушения развития имеют генетическое происхождение. Некоторые из них вызываются рецессивными генами, когда ребёнок должен унаследовать изменённую копию гена от обоих родителей. К таким заболеваниям относятся синдром Жубера, синдром Барде-Бидля и болезнь Тея-Сакса. Однако пока не проводили общую оценку распространённости таких генетических причин в разных популяциях.

Учёные объединили данные исследований DDD и GeneDx, чтобы выявить людей со схожим генетическим фоном. Всего было изучено 29 745 семей, более 20% из которых имели неевропейское происхождение.

Анализ данных позволил получить больше информации о небольших и малоизученных группах. Было обнаружено, что количество пациентов с рецессивными генетическими вариантами варьируется в зависимости от происхождения — от 2 до 19%. Эти различия связаны с распространённостью близкородственных браков в этих группах.

Исследователи обнаружили несколько генов, связанных с нарушениями развития. Это позволило поставить диагнозы семьям, которые раньше не могли получить помощь.

По оценкам исследователей, у примерно 12,5% пациентов может быть несколько генетических факторов, влияющих на их состояние. Это говорит о том, что данные расстройства могут быть сложными для диагностики и лечения.

Известные гены объясняют около 84% случаев, вызванных рецессивными генетическими вариантами, как у людей европейского, так и неевропейского происхождения.

Это позволяет предположить, что новые рецессивные гены, открытые за последние несколько лет, объясняют часть ранее недиагностированных пациентов с рецессивными причинами. Однако диагнозы по этим известным генам, связанные с изменениями ДНК, которые трудно интерпретировать, всё ещё не установлены.

Результаты подчёркивают важность улучшения интерпретации вредных генетических вариантов в известных генах, вызывающих заболевания.

Доктор Картик Чундру, который раньше работал в Институте Сэнгера, а теперь — в Эксетерском университете, рассказал, что исследование генов поможет диагностировать заболевания, которые раньше не удавалось выявить. Он также подчеркнул важность повторного анализа генетических данных с использованием новых методов и знаний. Это может помочь поставить диагноз без дополнительных анализов.

Доктор Винсент Устач, старший автор исследования в компании GeneDx, рассказал, что благодаря самой разнообразной группе участников удалось лучше понять нарушения развития у разных предков. Результаты этого исследования помогут семьям с больными детьми и расширят наши возможности по поиску ответов для малоизученных групп населения.

Доктор Хилари Мартин из Института Веллкома Сэнгера отметила, что у многих пациентов с известным генетическим диагнозом есть дополнительные редкие генетические изменения, которые способствуют развитию заболевания. Это поможет лучше понять состояние пациента, поставить более точный диагноз и, возможно, предложить новые методы лечения. Также это указывает на сложность генетических расстройств и необходимость полного генетического анализа.

23.09.2024