Ученые из Северо-Западного университета создали крупнейшую открытую базу данных, которая поможет исследователям сократить месяцы ранних этапов разработки лекарств.

Платформа SOAR (Spatial transcriptOmics Analysis Resource) позволяет изучать, как гены ведут себя в разных тканях, как клетки взаимодействуют между собой и какие новые методы лечения можно найти.

Пространственная транскриптомика — это передовой метод, который показывает активность генов в разных участках ткани, как карта с высоты птичьего полета.

SOAR объединяет данные 441 эксперимента от 19 компаний, охватывая 3461 образец тканей 13 видов (от человека до рыбки данио) и 42 типа органов — от мозга до кишечника.

Перебирать тысячи потенциальных препаратов перед доклиническими испытаниями дорого и долго, — говорит Юань Ло, руководитель проекта. — Нам нужно выбирать самые перспективные варианты, и SOAR в этом поможет.

Платформа работает как «молекулярный GPS»: показывает, где и какие гены включаются, как на это влияют химические вещества. Это помогает точнее находить мишени для терапии. Например, при болезни Крона иммунные клетки атакуют здоровые ткани, а при раке, наоборот, не трогают опухоль. SOAR позволяет разобраться в этих механизмах.

Результаты исследования опубликованы в Science Advances, а несколько фармкомпаний уже тестируют платформу в своих разработках.

Главное преимущество SOAR — ускорение поиска мишеней для лекарств. Сейчас на ранних этапах ученые тратят месяцы на ручной анализ данных, а здесь все структурировано. Это особенно важно для сложных заболеваний вроде рака или аутоиммунных болезней, где ключевую роль играет не просто активность генов, а их локализация в ткани. Плюс — открытый доступ: даже небольшие лаборатории смогут использовать эти данные без огромных бюджетов.

Основной риск — переоценка возможностей AI в анализе. SOAR дает корреляции, но не доказывает причинно-следственные связи. Например, если ген активен в опухоли, это не всегда значит, что его подавление вылечит рак. Нужны дополнительные эксперименты. Также пока неясно, как часто база будет обновляться: методы пространственной транскриптомики быстро развиваются, и данные могут устаревать.

Ранее ученые предложили новый метод исследования нейротоксичности.