ИИ-платформа для анализа изображений поможет развивать исследования во всем мире

Группа исследователей из Института Гульбенкяна, Instituto Gulbenkian de Ciência, IGC, в Португалии совместно с университетом Åbo Akademi в Финляндии, консорциумом AI4Life и другими партнерами разработала инновационную платформу с открытым исходным кодом под названием DL4MicEverywhere.

Результаты работы опубликованы сегодня в журнале Nature Methods.

Эта платформа предоставляет ученым, изучающим жизнь, легкий доступ к передовому искусственному интеллекту (ИИ) для анализа микроскопических изображений. Она позволяет другим исследователям, независимо от их опыта в области вычислений, легко обучать и использовать модели глубокого обучения на своих собственных данных.

Глубокое обучение, одно из направлений искусственного интеллекта, произвело революцию в анализе больших и сложных наборов микроскопических данных, позволив ученым автоматически идентифицировать, отслеживать и анализировать клетки и субклеточные структуры. Однако нехватка вычислительных ресурсов и опыта в области ИИ не позволяет некоторым исследователям в области наук о жизни использовать эти мощные методы в своей работе. DL4MicEverywhere решает эти проблемы, предоставляя исследователям интуитивно понятный интерфейс для использования моделей глубокого обучения в любых экспериментах, требующих анализа изображений, и в различных вычислительных инфраструктурах, от простых ноутбуков до высокопроизводительных кластеров.

Наша платформа устанавливает мост между технологическими достижениями ИИ и биомедицинскими исследованиями, — говорит Иван Идальго-Кенамор, первый автор исследования и научный сотрудник IGC (на фото).

С ее помощью исследователи, независимо от их опыта в области ИИ, получают доступ к передовым методам микроскопии, что позволяет им автоматически анализировать свои результаты и потенциально открывать новые биологические знания.

Платформа DL4MicEverywhere основана на предыдущей работе команды, ZeroCostDL4Mic, и позволяет обучать и использовать модели в различных вычислительных средах. Платформа также включает в себя удобный интерфейс и расширяет коллекцию доступных методик, которые пользователи могут применять для решения общих задач анализа изображений микроскопии.

Цель DL4MicEverywhere — демократизировать ИИ для микроскопии, поощряя вклад сообщества и придерживаясь принципов FAIR для программного обеспечения научных исследований — сделать ресурсы доступными для поиска, взаимодействия и многократного использования, — поясняет доктор Эстибализ Гомес-де-Марискаль, соруководитель исследования и научный сотрудник IGC.

Мы надеемся, что эта платформа позволит исследователям во всем мире использовать эти мощные методы в своей работе, независимо от их ресурсов и опыта.

Разработка DL4MicEverywhere — отличный пример совместной работы в науке. Во-первых, она была разработана с целью дать возможность любому исследователю во всем мире воспользоваться самыми передовыми технологиями в области микроскопии, способствуя ускорению научных открытий. Во-вторых, это стало возможным только благодаря международному сотрудничеству экспертов в области компьютерных наук, анализа изображений и микроскопии при ключевом участии консорциума AI4Life. Соруководителями проекта выступили Рикардо Энрикеш из IGC и Гийом Жакеме из Университета Або Академи.

Эта работа представляет собой важную веху на пути к тому, чтобы сделать ИИ более доступным и многократно используемым для сообщества микроскопистов, — сказал профессор Жакеме.

Позволив исследователям легко обмениваться своими моделями и аналитическими схемами, мы сможем ускорить открытия и повысить воспроизводимость результатов биомедицинских исследований.

«DL4MicEverywhere имеет потенциал для преобразований в области наук о жизни», — добавил профессор Энрикес. „Он соответствует нашему видению AI4Life — разрабатывать устойчивые решения в области ИИ, которые расширяют возможности исследователей и стимулируют инновации в здравоохранении и за его пределами“.

Платформа DL4MicEverywhere находится в свободном доступе как ресурс с открытым исходным кодом, что отражает приверженность команды к открытой науке и воспроизводимости. Исследователи считают, что, снизив барьеры для передового анализа микроскопических изображений, DL4MicEverywhere позволит совершить прорывные открытия в самых разных областях — от фундаментальной клеточной биологии до открытия лекарств и персонализированной медицины.

17.05.2024


Подписаться в Telegram



Net&IT

Инженеры воссоздали голопалубу Star Trek с помощью ChatGPT и видеоигр
Инженеры воссоздали голопалубу Star Trek с помощью ChatGPT и видеоигр

В сериале Звездный путь: Следующее поколение к...

Physical Review X: Сеть квантовых датчиков повышает точность измерений
Physical Review X: Сеть квантовых датчиков повышает точность измерений

Квантовые системы, используемые в квантов...

Scientific Reports: ИИ показал больший творческий потенциал, чем человек
Scientific Reports: ИИ показал больший творческий потенциал, чем человек

Еще один балл в пользу искусственного инт...

Крошечную метку на замену RFID сделали еще надежнее
Крошечную метку на замену RFID сделали еще надежнее

Несколько лет назад исследователи Массачу...

Ученые приблизились к более легким и гибким оптоэлектронным устройствам
Ученые приблизились к более легким и гибким оптоэлектронным устройствам

Органические оптоэлектронные устройства, такие...

PNAS Nexus: ИИ пока еще далеко до человеческих способностей мыслить
PNAS Nexus: ИИ пока еще далеко до человеческих способностей мыслить

Атанасиос С. Фокас рассматривает актуальный во...

Nature: ИИ генерирует белки с исключительной прочностью связывания
Nature: ИИ генерирует белки с исключительной прочностью связывания

В новом исследовании, опубликованном 18 декабр...

Nature Computational Science: ИИ может предсказывать события в жизни людей
Nature Computational Science: ИИ может предсказывать события в жизни людей

Искусственный интеллект, разработанный для&nbs...

Nature Electronics: Изменение памяти дает новые вычислительные возможности
Nature Electronics: Изменение памяти дает новые вычислительные возможности

Ученые Рочестерского университета разработали ...

Nature: 2D-материал изменяет форму 3D-электроники для искусственного интеллекта
Nature: 2D-материал изменяет форму 3D-электроники для искусственного интеллекта

Многофункциональные компьютерные чипы эволюцио...

Началась регистрация на конкурс «Битва искусственных интеллектов»
Началась регистрация на конкурс «Битва искусственных интеллектов»

Стартовал отборочный этап Международного техно...

Поиск на сайте

Знатоки клуба инноваций


ТОП - Новости мира, инновации

Applied Catalysis: MXene поможет получать экономически выгодный зеленый водород
Applied Catalysis: MXene поможет получать экономически выгодный зеленый водород
35% переболевших коронавирусом в течение года столкнулись с ухудшением здоровья
35% переболевших коронавирусом в течение года столкнулись с ухудшением здоровья
Science Immunology: Воспаление мозга вызывает мышечную слабость после инфекций
Science Immunology: Воспаление мозга вызывает мышечную слабость после инфекций
Acta Biomaterialia: Гидрогель поможет понять механизм развития Альцгеймера
Acta Biomaterialia: Гидрогель поможет понять механизм развития Альцгеймера
CSAA: Как восстановить мир в городе после конфликта — проблемы и перспективы
CSAA: Как восстановить мир в городе после конфликта — проблемы и перспективы
Новая технология фотоэлектрических модулей оптимизирована для городских условий
Новая технология фотоэлектрических модулей оптимизирована для городских условий
Nature Ecology & Evolution: Всеобщий предок LUCA оказался старше, чем считалось
Nature Ecology & Evolution: Всеобщий предок LUCA оказался старше, чем считалось
ИИ лучше клинических тестов справился с прогнозом течения болезни Альцгеймера
ИИ лучше клинических тестов справился с прогнозом течения болезни Альцгеймера
International Journal of Hydrogen Energy: К 2045 году будем летать на водороде
International Journal of Hydrogen Energy: К 2045 году будем летать на водороде
IEEE Access: Ученые открыли доступ к данным о работе электрических сетей
IEEE Access: Ученые открыли доступ к данным о работе электрических сетей
Нанопластики нарушают структуру и функциональность белков в грудном молоке
Нанопластики нарушают структуру и функциональность белков в грудном молоке
Nature Neuroscience: Ученые доказали, что терпение приносит свои плоды
Nature Neuroscience: Ученые доказали, что терпение приносит свои плоды
Cell: Впервые восстановлена трёхмерная структура хромосом шерстистого мамонта
Cell: Впервые восстановлена трёхмерная структура хромосом шерстистого мамонта
Познакомьтесь со странной амфибией, которая выкармливает своих детенышей молоком
Познакомьтесь со странной амфибией, которая выкармливает своих детенышей молоком
В 40% случаев люди ошибочно называют сгенерированное фото человека реальным
В 40% случаев люди ошибочно называют сгенерированное фото человека реальным

Новости компаний, релизы

Ведущие игроки агрорынка представят новинки на «Дне поля» в Агробиотехнопарке Казанского ГАУ
Межсетевой экран защитит компьютерные системы от киберугроз
Университет МИСИС будет готовить специалистов в сфере квантовых технологий
Казанский ГАУ запускает подготовку специалистов по экологии и природопользованию
40% профессионалов предпочитают работать удаленно с дачи